國際航班、貨運包機特種物品、危險品運輸、收運、裝卸是機場貨運業務的組成部分，1997年機場開航至今，貨運就把國際貨運業務中的危險品管理、運輸、裝卸、儲藏、提取視為重要的常態化操作業務，也是國際貨運運行業務利潤不可缺少的部分，18年時間，機場國際航班、貨運包機開通，此項業務安全正常運轉，業務量有增無減少，通過18年的機場國際貨運已經具備、擁有了一批經過實踐實際操作、通過民航、機場及各級專業培養的危險品業務操作人員隊伍，通過近幾年的不斷的完善，危險品運輸南京機場國際航班出港、中轉、進港業務量中，在國際貨物中一直占有一定的比例，18年來機場貨運在開拓國際貨運市場的同時，制定適合國際貨物危險品操作流程、防范措施、安全制度，注重強化人員資質培訓和業務培訓，并在國際貨運特種貨物區，專門設立了“危險九大類倉庫”隨著國際業務發展，機場貨運的轉型加速，到目前為止，機場貨運已經儲備了一批通過專業培訓國際航班、包機危險品業務操作的人員，截止2015年3月16日，貨運保障部已經有166人獲得了不同等級學習培訓和操作資質、上崗證書，也培訓一批危險操作專業操作人員，作為華東地區備降機場，南京祿口機場貨運將以更專業姿態、更規范的操作，將為國際航班、國際貨運包機，提供更嚴謹危險品運輸、裝卸、操作，為廣大的社會貨運代理提供更好的危險倉儲、提取服務。

南京祿口國際機場國際貨運通過努力，已經連續18年實現國際危險品運輸業務、裝卸、操作無隱患、無差錯，具有專業水準。